La compétition internationale est forte dans le champ d’activité d’AGENAE et, plus généralement, dans celui des productions animales. Il faut donc produire mieux et innover en permanence pour s’inscrire dans la dynamique mondiale et accroitre la compétitivité des entreprises françaises.
En associant les principaux partenaires de l’élevage et de l’alimentation animale, publics et professionnels français concernés, AGENAE a vocation à doter la France d'un dispositif global susceptible de s’ouvrir sur l'Union Européenne, cohérent et compétitif pour l'étude et l'exploitation des génomes animaux.
Le Partenariat Européen pour l’Innovation (PEI, volet majeur du 8ème PCRD « Horizon 2020 ») constitue un cadre nouveau dans lequel cette construction exemplaire du partenariat public-privé d’AGENAE inscrit délibérément ses actions.