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Les enjeux

Parmi les avancées scientifiques qui marquent la période actuelle dans le domaine de la biologie, les développements conjoints de la génomique et de la biologie intégrative occupent une place de tout premier plan. En amont, la génomique permet d’acquérir de nouvelles connaissances sur l’identité et la fonction des gènes intéressant l’élevage. En aval, la biologie intégrative et les recherches en physiologie ouvrent la voie à des progrès considérables dans notre capacité à améliorer la compétitivité de l’élevage, la santé animale, l’acceptabilité des modes de conduite des troupeaux et la qualité des produits d’origine animale.
Devant l’importance stratégique de ces enjeux scientifiques et économiques, plusieurs pays ont mobilisé des moyens de recherche de grande ampleur pour l’étude systématique des génomes des animaux de rente.
 
Les enjeux sont de deux ordres :
 
~ progresser dans la compétitivité et l’acceptabilité de l’élevage nécessite une maîtrise accrue de la reproduction et du développement précoce, de la croissance, de la nutrition, de l’immunité et de la santé, du bien-être des animaux. L’accès à une connaissance renouvelée des grandes fonctions physiologiques et de leurs interactions passe par les nouvelles approches systématiques de la génomique et suppose que soit entreprise une démarche de biologie intégrative s’intéressant à différents niveaux d’organisation du vivant, depuis la fonction des gènes jusqu’aux fonctions complexes d’un organisme interagissant en permanence avec son environnement ;
 
~ l’autre enjeu, qui se pose dans un contexte d’intense compétition internationale, est de gérer la diversité génétique des populations animales en s’appuyant sur l’identification des variants de gènes contribuant de façon importante à la variabilité des caractères d’intérêt agronomique. Les nouveaux outils de la génomique renforcent notre capacité à décrire ces polymorphismes dans les populations puis à les exploiter dans les programmes d’amélioration génétique. La maîtrise de nos choix génétiques pourra être ainsi préservée, en évitant que la totalité des informations de séquence, d’expression et de fonction des gènes des animaux de rente soient inaccessibles ou protégées par des brevets étrangers.
 
Le caractère de plus en plus intégré des recherches en génétique, en physiologie et en physio-pathologie, le niveau élevé des investissements requis, l’importance des retombées potentielles pour tous les acteurs des filières animales imposent de se doter d’un dispositif de recherche ambitieux permettant de conserver une réelle capacité d’innovation et de rester en bonne place au niveau international.
 
Enfin l’accélération des technologies d’acquisition à très haut débit de données sur les génomes exige de repenser complètement les approches de la physiologie et celles de la gestion des populations et de la biodiversité. Pour ne parler que d’espèces d’intérêt économique majeur, le séquençage complet des génomes des bovins et de la poule est acquis, ceux du cheval et du porc seront bientôt disponibles, celui des salmonidés est prévu à court terme. L’analyse évolutive de la comparaison de tous les génomes apporte des éclairages nouveaux sur les fonctions des gènes et sur la compréhension des déterminismes génétiques des caractères. L’exploration de la diversité intra spécifique des séquences, combinée à l’essor de nouvelles technologies, permet aujourd’hui d’analyser la diversité génétique des populations à l’échelle des génomes entiers, ouvrant la voie à une évolution rapide des méthodes de gestion et de sélection des races.
 
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Rédaction : P.Hubert
Date de création : 06 Février 2008
Mise à jour : 30 Mai 2008

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