Le programme AGENAE a pour ambition de développer des recherches génériques et des actions de recherche finalisées dans le domaine de la génomique animale. Il vise, au sein de quatre espèces majeures (bovin, porc, poule et truite), à identifier la partie exprimée du génome, à renforcer la contribution des équipes françaises à la cartographie des génomes entiers et à initier une recherche systématique des expressions génétiques diverses dans les populations animales.